Candy Merge funziona su un sistema di unione basato su tessere dove caramelle identiche si combinano per creare dolci di livello superiore. Il tabellone di gioco consiste in una griglia 5x5 che si riempie con pezzi di caramelle casuali dopo ogni mossa. Quando trascini due caramelle corrispondenti insieme, si fondono nella prossima evoluzione della catena delle caramelle.
Il sistema di progressione tiene traccia di oltre 50 tipi distinti di caramelle, ognuno con valori di punti specifici e requisiti di sblocco. Man mano che avanzi attraverso i livelli di unione, sblocchi potenziatori di produzione che generano automaticamente caramelle di livello inferiore ogni 30 secondi. Il moltiplicatore combo aumenta di 1,5x per ogni unione consecutiva completata entro 10 secondi.
La gestione strategica delle tessere diventa critica ai livelli più alti dove lo spazio del tabellone è limitato. Il gioco impiega un sistema di caduta basato sulla fisica dove nuove caramelle cadono dall'alto per riempire gli spazi vuoti, creando opportunità di reazioni a catena per giocatori esperti che pianificano attentamente le loro sequenze di unione.